近年来，随着“国库集中收付”制度实施，而对“会计集中核算”逐渐弱化，认为“国库集中收付”可以替代“会计集中核算”,其实不然，两者概念截然不同，有着不同的内涵。
　　“国库收付”也叫“国库集中收付”，它是贯穿于财政预算执行的全过程，是预算执行制度创新，是与公共财政改革和实行部门预算相伴生的一项配套制度，是与财政收支分类改革相适应的，逐步建立和完善以国库单一账户体系为基础，资金缴拨以国库集中收付为主要形式的财政国库管理制度，有利于规范财政收支行为，加强财政收支管理，提高财政资金使用效益。国库集中支付是国库集中收付制度中的一个方面，即资金直达，减少中间环节，是总预算会计拨付资金的方式。

　　“会计核算”也叫“会计集中核算”，它是由“会计委派制”演变而来的，会计委派制就是把会计人员由各个单位分散管理，改为由财政部门（或会计管理局）统一管理，然后再委派到各个单位做财务工作，这样在实践中鞭长莫及，愿望和出发点都很好，但是效果难以实现；为此，逐步把会计人员集中起来做账，成立会计核算中心，集中统一管理会计人员，集中核算各个单位的会计账务，这样有利于规范会计行为，提高会计工作质量，通过专业会计人员做账，大大提高会计基础工作规范。

　　对不同规格的机关，应采用不同模式，不能一概而论，不能把“国库集中收付”与“会计集中核算”混为一谈，如果概念不清，就会使工作开展容易偏离方向；对于“国库集中收付”和“会计集中核算”制度，应当区别省级以上机关和市县以下基层地方机关分别实施。

　　国库集中收付制度，可以在各级财政部门实施，都是非常必要的。就中央和省级而言，由于中央和省级国家机关事业单位资金拨付量大，部门和机关事业单位都有规范的会计机构，会计人员专业化水平高，有利于国库集中收付制度的施行，通过推行财政部门的国库集中收付制度，就足够解决问题，仍然可以继续保留各个国家机关事业单位的会计处室，进行各自的机关事业单位的会计核算，没有必要实行会计集中核算。

　　在县、市级基层地方部门和机关事业单位中，情况绝然不同，有的机关事业单位的会计机构不健全，有的小单位人员较少，会计还是兼职的，光靠财政部门推行国库集中收付制度是不够的，很难规范管理，应当把会计人员也由核算中心集中统一管理，账务集中核算。就是把会计人员由单位分散管理，转向集中统一管理，并不改变各单位的会计核算主体，而是由集中核算中心办理记账集中核算。